盆底肌痉挛综合征实质是功能性排便出口梗阻。排便时，不仅肛管直肠角(ARA)不增大，甚至有变小趋势并且肛管水平不向下降，提示此种盆底肌痉挛可能以耻骨直肠肌为主，但其肌纤维并不肥大。有人认为，本征是耻骨直肠肌综合征的前期阶段，但证据并不充分。

  本症的主要症状是排便困难，便时疼痛。约有半数病人有粘液血便。